Pastoralkurse
Die zweite Bildungsphase beginnt mit der Aufnahme in den sogenannten Pastoralkurs.
In den Pastoralkurs werden nur diejenigen Kandidaten aufgenommen, die das theologische Abschlussexamen (Diplom/Master) erfolgreich absolviert haben. Auch stoßen hier die Absolventen des Priesterseminars St. Lambert/Lantershofen hinzu. Im Pastoralkurs läuft die Ausbildung gemeinsam mit dem Zentrum für PastoralassistentInnen. In dieser Zeit werden Blockveranstaltungen in Speyer und Würzburg absolviert, welche die Zeit in den Praktikumspfarreien unterbrechen. Jeweils am dritten Adventssonntag werden die Alumnen in den Kreis der Weihekandidaten aufgenommen; sie erhalten die sogenannte ›Admissio‹.
Nach einem Jahr werden die Priesteramtskandidaten des Pastoralkurses zu Diakonen geweiht. Während des sogenannten Diakonatskurses erhalten die Diakone eine theoretische Ausbildung in Blockveranstaltungen in Würzburg, während sie weiterhin in ihren Praktikumspfarreien tätig sind. Ein halbes Jahr nach der Diakonenweihe erhalten sie am Pfingstsamstag die Priesterweihe im Würzburger Kiliansdom.